Metamorfosiskyrkan
I hamnen i Pythagorion, högt uppe på en kulle, hittar du Lykourgos Logothetis borg. Alldeles intill ligger Metamorfosiskyrkan från 1831, och om du besöker kyrkan undrar du kanske vad som döljer sig i boxarna med foton och namn. Svaret är dödskallar. Enligt en grekisk tradition grävs nämligen gravarna upp efter 6-10 år. När benen blivit vita menar man att den döda blivit fri från sina synder och man placerar skallen i kyrkan. På hotellen Evripili och Polixeni bor du med ett bekvämt gångavstånd från borgen och kyrkan.
Heratemplet
Heratemplet, som var ett av antikens mest betydelsefulla tempel, är i dag en av Samos främsta sevärdheter. De fina tempellämningarna ligger i Ireon väster om Pythagorion, cirka tio minuter från flygplatsen. Under åren har templet förstörts flera gånger, men byggts upp igen.